Olarak sıralanabilir. Çoğu yan etki çok kısa sürede kaybolur. Bunlara ek olarak yorgunluk ve baş ağrısı gözlemlenebilir. Nöbetler gibi nörolojik belirtiler çok nadirdir. Nadiren de olsa, doku hasarları meydana gelebilmektedir. Bunların yanında, yine son derece nadir olarak rastlansa da tanı ve duruma bağlı olarak görme ve işitme kaybı da rastlanabilen yan etkiler arasındadır. Cyberknife tedavisi sırasında, saç dökülmesi ve cilt yanması çok düşük ihtimal ile gerçekleşen etkiler arasında yer almaktadır. Tipik olarak verilen radyasyon dozu, cilde zarar verecek düzeylerde değildir. Sac köklerinde zarar oluşmadığından döküntü olması durumunda tekrar saç büyümesi mümkün olacaktır.

Cyberknife yan etkileri yukarıda özetlendiği şekilde oluşabilir ancak komplikasyonlar hafif ve genellikle geçicidir. Komplikasyonlar genelde tedavi alınan bölge ile ilgilidir. Tedavi alınan bölgeye bakılmaksızın genel olarak ortaya çıkan belirtiler de söz konusu olabilmektedir. Bununla birlikte spesifik yan etkiler, tedavi altındaki bölgelere göre değişiklik gösterebilir. Tedaviye başlamadan önce bu hususların doktorunuz ile görüşülmesi tavsiye edilir.